25-åringen misstänks ha våldtagit den värmländska tonårsflickan.
DNA-spår kopplar honom till brottet.
Enligt åklagaren Joanna Larsen är han bekant med 23-åringen som suttit frihetsberövad sedan oktober.
– Det är inga gemensamma gärningar de är misstänkta för, säger hon.
Ytterligare en man har häktats misstänkt för ett fall av våldtäkt mot den värmländska tonårsflickan som försvann från Värmland i höstas.
Det handlar om en 25-årig man som är känd av polisen sedan tidigare för mindre allvarliga brott.
Ännu en man misstänkt för brott mot försvunna tonårsflickanSedan i oktober förra året sitter även en 23-årig man frihetsberövad misstänkt för två fall av våldtäkt.
Det är även denna man som misstänkt ha groomat flickan – som anmäldes försvunnen och saknades i flera dagar – från Värmland till Göteborg,.
– Min uppfattning är att de (de misstänkta gärningsmännen) är bekanta med varandra sedan tidigare, säger förundersökningsledaren Joanna Larsen.
– Men de är inte misstänkta för några brott i samförstånd, utan det är enskilda misstankar vid olika tidpunkter. Det är inga gemensamma gärningar de är misstänka för.
25-åringen häktades under torsdagen förra veckan.
– Det är ett brott som ska ha skett mellan den 8 oktober och 11 oktober förra året.
Efter att flickan anmälts försvunnen blev det stort sökpådrag efter henne. Till slut hittades hon några dagar senare i Borås av sin mamma.
Enligt åklagaren ska den senare våldtäkten ha skett i Boråstrakten. 25-åringen är också hemmahörande i området.
Mannen har tidigare betraktats som ett vittne i utredningen.
– Det jag kan säga är att det är framför allt teknisk bevisning i form av DNA som har gjort att han i ett senare skede blivit misstänkt för brott.
Joanna Larsen vill inte gå in på uppgifterna hur den värmländska tonårsflickan och 25-åringen kom i kontakt med varandra.
– Det här är en person, som jag påstår, att målsägande har vistats tillsammans med efter att hon lämnat Göteborg och också då efter att den första personen blev frihetsberövad. Min uppfattning är att han också befunnit sig i Göteborg.
De båda misstänkta gärningsmännen nekar till brott.
Snart hoppas Joanna Larsen bli klar med utredningen för att kunna ta ett beslut om hon ska väcka åtal eller inte.
– Utredningen väntas bli klar i slutet av denna månad eller i början på nästa.